Nacido en Colombia, Juan Carlos Arango recibió el titulo de oboísta en la Universidad de Brasilia, Brasil, bajo la orientación del profesor Vaclav Vinecky. Siendo alumno del profesor Michael McCraw en el Early Music Institute de Indiana University Bloomington obtuvo el titulo de intérprete del bajón y fagot barroco.

El ha participado en varios ensambles de música antigua tales como Música Ficta y el Ensemble Lipzodes. Ha actuado en Festivales Internacionales como el Singapore Festival of Arts; JakArts Festival, Jakarta; II Festival de Música Antigua y Religiosa de Bogotá; Festival de Música Antigua y Barroca "Los Fundadores," San Luis Potosí, Mexico; II Latin-American Baroque Music Festival of Chiquitos, Bolivia; X Festivale Il Canto delle Pietre, Italy. Igualmente se ha presentado en The Education Ministry of the Embassy of Spain en Philadelphia, la Embajada de Colombia en Tokyo, The Mexican Cultural Institute, Washington, D.C., y The Cleveland Museum of Art en Ohio, Estados Unidos.

En 2003 Juan fue parte del cuerpo de profesores en The Third Annual Magdalena Early Music Workshop en Nuevo Mexico. También ha actuado como coordinador de los instrumentos de viento del Plan Nacional de Bandas, un proyecto del Ministerio de Cultura en Colombia. Además, el ha sido un profesor activo de oboe, música de cámara y teoría de la música en prestigiosas universidades en Colombia. Actualmente trabaja en el Latin American Music Center (LAMC), de Indiana University Bloomington. Ha grabado para el sello Milan-Jade.